（二）有序推進
結合東部、中部、西部和東北等區域發展重點，圍繞推動京津冀協同發展、加快長三角核心區域率先創新轉型、深化粵港澳創新合作、促進產業承東啟西轉移和調整、加速軍民深度融合發展、推進新型工業化進程，選擇1個跨省級行政區域（京津冀）、4個省級行政區域（上海、廣東、安徽、四川）和3個省級行政區域的核心區（武漢、西安、沈陽）進行系統部署，重點促進經濟社會和科技等領域改革的相互銜接和協調，探索系統改革的有效機制、模式和經驗。其中河北依托石家莊、保定、廊坊，廣東依托珠江三角洲地區，安徽依托合（肥）蕪（湖）蚌（埠）地區，四川依托成（都）德（陽）綿（陽）地區，開展先行先試。在相關地方提出改革試驗方案的基礎上，按照方案成熟程度，逐個報國務院審批后啟動實施。
四、組織實施
（一）加強組織領導
國家科技體制改革和創新體系建設領導小組加強對全面創新改革試驗工作的統籌協調，審議有關改革試驗重大任務、布局、政策和措施建議。在國家科技體制改革和創新體系建設領導小組下，建立部際協調機制，由國家發展改革委擔任召集人單位、科技部擔任副召集人單位，會同相關部門、承擔試驗任務所在區域省級政府等組成，指導全面創新改革試驗工作，討論改革試驗方案，統籌協調改革試驗中的重大政策問題，考核、評估改革試驗工作。承擔試驗任務所在區域要建立健全省級層面協調機制，負責研究提出改革試驗方案，推進落實改革試驗任務，配合做好改革試驗成效評估和成果推廣應用工作。
（二）建立政策措施保障機制
針對改革試驗任務部署和需求，各相關部門要積極研究支持改革試驗的政策措施，預先做好有關工作安排和部署，確保后續改革試驗工作順利推進，一些探索開展先行先試的重大改革舉措要率先在試驗區域落地，改革舉措需要暫時調整實施有關法律、行政法規、國務院文件和經國務院批準的部門規章的部分規定的，按規定程序辦理；積極創新支持方式，加強政策協同，支持和允許改革試驗過程中試錯、容錯和糾錯；積極支持試驗區域內的中央級科研機構、高等學校經主管部門授權參加相關改革試驗。相關地方政府要設計好改革試驗任務，狠抓重大改革舉措落實，在其職責范圍內研究制定相應的配套政策措施，做好與相關部門的銜接和協調，切實形成合力。
（三）做好監督評估和推廣應用工作
發揮部際、省級協調機制作用，由國家發展改革委和科技部會同有關部門，組織對試驗地區進行年度監督檢查和第三方評估工作，及時發現和解決問題，宣傳和推廣典型經驗。根據改革試驗年度監督檢查和評估情況，按成熟程度及時分類提出重大改革舉措推廣建議。對較為成熟的改革舉措，報國務院批準后在更大范圍推廣。
（四）實施進度安排
2015年，京津冀、上海、廣東、安徽、四川、武漢、西安、沈陽研究制定改革試驗方案，協調落實有關改革舉措，明確階段任務和目標，條件成熟后逐項報國務院批準實施。
2016年，全面推進落實試驗區域的改革部署，開展階段總結評估，對成熟的改革舉措及時向全國推廣。
2017年后，滾動部署年度改革試驗任務，組織開展對試驗區域的中期評估，適時推廣重大改革舉措。
試驗區域的改革試驗方案原則上規劃3年，每項改革試驗任務在1年內形成可推廣、可復制經驗。
相關區域的省級政府組織研究編制具體改革試驗方案，提出改革試驗的主要任務、目標、時間表、路線圖和政策需求等，向國家發展改革委和科技部報送申請并抄送相關部門。國家發展改革委和科技部會同相關部門，在部際協調機制下，共同研究改革試驗方案，提出試驗建議，經國家科技體制改革和創新體系建設領導小組審議后，報國務院審批。
各有關部門和地方要按照本方案精神，統一思想，密切配合，強化全局和責任意識，勇于創新，主動改革，積極作為，抓好落實，確保改革試驗工作取得實效。各有關方面要及時總結、宣傳改革試驗進展和成效，加強社會輿論導向，營造有利于改革的良好社會環境。
